OGM_web_3
Optické mapování genomu odhaluje nové strukturní varianty u pacientů s autismem

V květnu 2025 byla v časopise Computational and Structural Biotechnology Journal publikována studie, která rozšiřuje poznatky o komplexní genetice poruch autistického spektra (ASD). Vědcům z Harbin Medical University v Číně se pomocí moderní technologie optického mapování genomu (OGM) podařilo u pacientů s ADS identifikovat několik set dosud nepopsaných strukturních variant (SV).

Strukturní varianty: Jedná se vždy o problém?
Strukturní varianty jsou běžnou součástí genetické rozmanitosti člověka a vyskytují se i u zcela zdravých jedinců. Každý člověk nese tisíce SV, které ve většině případů nepředstavují zdravotní riziko. Přibližně 13% lidského genomu je označeno jako strukturně variabilní, přičemž se většina SV nachází v
jeho nekódujících oblastech, kde obvykle nenarušují funkci genů.

Co výzkum ukázal?
Pomocí technologie OGM, která umožňuje vizualizaci dlouhých molekul DNA v jejich nativní podobě, autoři analyzovali genomy 26 pacientů s
ASD. Klíčovou výhodou této metody je její vysoká citlivost detekce některých typů chromosomálních aberací – zejména větších inzercí, delecí, inverzí a translokací – které mohou uniknout i pokročilým molekulárně-genetických přístupům, jako je sekvenování nové generace (NGS).

Vtéto kohortě pacientů bylo celkem identifikováno 1593 nových strukturních variant. U 114 znich byl zaznamenán opakovaný výskyt alespoň u dvou různých jedinců, což vedlo autory k jejich označení jako potenciálně kandidátních SV spojených s ASD. Zvláštní pozornost byla následně věnována 57 variantám, které zasahovaly do kódujících oblastí genomu a mohly tak mít přímý dopad na genovou expresi nebo funkci proteinu.

Proč je to důležité?
Výsledky studie ukazují, že OGM může zásadně rozšířit možnosti genetické diagnostiky u neurovývojových poruch, obzvláště u pacientů, u nichž tradiční testy selhaly.

 

 

Zdroj

Zhang Y, Chien WT, Chan JYW, et al. Optical genome mapping reveals novel structural variations in an autism spectrum disorder cohort. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2025;27:2233-2242. doi:10.1016/j.csbj.2025.05.043

Vezměte osud a Vaše zdraví
do vlastních rukou