NTRK fúze: Malé mutace, velký význam 

Genové fúze NTRK (NTRK1, NTRK2, NTRK3) jsou vzácné genetické změny, které mohou stát za vznikem různých typů nádorů u dospělých i dětí. Právě nádory s těmito fúzemi často dobře reagují na cílenou léčbu pomocí tzv. TRK inhibitorů – moderní skupiny léků, které dokážou „vypnout“ patologickou aktivitu těchto genových produktů. Rutinní testování NTRK fúzí dnes doporučují mezinárodní odborné společnosti, protože umožňuje konkrétním pacientům přístup k účinné personalizované terapii. 

Proč je testování NTRK fúzí složité? 

Identifikace těchto vzácných fúzí je složitá, protože běžné DNA testy nebo imunohistochemie často nenajdou všechny typy fúzí – mnohé zlomové body jsou totiž v rozsáhlých, špatně sekvenovatelných intronech. RNA hybrid-capture sekvenování však umožňuje cíleně a efektivně zachytit právě aktivní fúze v transkriptu, tedy v přepisované nukleové kyselině. Nová studie Wallena a kolegů představuje největší analýzu tohoto typu, kde bylo RNA hybrid-capture NGS využito pro 19 591 reálných vzorků různých solidních tumorů napříč 35 typy nádorů v běžné klinické praxi. 

Jaké byly výsledky? 

Autoři objevili 73 onkogenních nebo pravděpodobně onkogenních NTRK fúzí v 69 unikátních vzorcích z 19 různých typů nádorů. Nejvyšší výskyt byl pozorován u glioblastomu (1,91 %), nádorů tenkého střeva (1,32 %) a hlavy/krku (0,95 %). Naprostá většina tumorů s NTRK fúzí byla v pokročilém stádiu. Zajímavé je, že fúze byly nalezeny jak v typických partnerech (např. ETV6, TPM3, LMNA, EML4, TPR), tak ve 41 nových, dosud nepopsaných genových partnerech. Tyto nově objevené fúze by běžné DNA testy často přehlédly – právě RNA sekvenování je dokázalo identifikovat. 

U většiny pacientů s NTRK fúzí se jednalo o tzv. „driver“ mutace, které samy řídily růst nádoru, nicméně u třetiny případů byly identifikovány i další genomické změny (např. mutace TP53, KRAS, nebo EGFR) – což může ovlivnit volbu léčby v konkrétní situaci. Zároveň byla analyzována i propojení s biomarkery imunoterapie (TMB, MSI, PD-L1), které v některých typech nádorů ukázaly na možnost kombinované léčby. 

Proč je RNA hybrid-capture NGS tak zásadní? 

Studie podtrhuje, že RNA hybrid-capture sekvenování nejen dokáže identifikovat známé i nové fúze tam, kde jiné metody selhávají, ale zároveň umožňuje efektivní testování v klinické praxi napříč různými nádory. Lékaři tak mohou přesně vyhledat pacienty vhodné pro tzv. TRK inhibitory (larotrectinib, entrectinib, repotrectinib), což zvyšuje šance na úspěšnou cílenou terapii i u méně typických nebo pokročilých diagnóz. 

Význam pro pacienty a moderní diagnostiku 

Díky těmto výsledkům se RNA hybrid-capture sekvenování ukazuje jako nejlepší metoda pro detekci NTRK fúzí v běžné klinické péči, což může znamenat zásadní změnu v přístupu k léčbě vzácných a složitých nádorů. Přesná identifikace fúzí vede k šanci na personalizovanou, moderní léčbu a ke zlepšeným výsledkům pro pacienty. Tento pokrok posouvá genetické testování o další úroveň blíž každodenní medicíně.

Zdroj:
Wallen, Z. D., Tierno, M., Schnettler, E., Roos, A., Green, M., Amoah, K., Previs, R. A., Hastings, S., Pabla, S., Jensen, T. J., Caveney, B., Eisenberg, M., Sathyan, P., Ramkissoon, S. H., & Severson, E. A. (2025). RNA hybrid-capture next-generation sequencing has high sensitivity in identifying known and less characterized oncogenic and likely oncogenic NTRK fusions in a real-world standard-of-care setting. Frontiers in Genetics, 16:1550706. https://doi.org/10.3389/fgene.2025.1550706