Výzkumný tým vedený Andrem Minoche publikoval průlomovou studii, která mění pohled na genetické testování jednoho z nejčastějších dědičných srdečních onemocnění. Dilatační kardiomyopatie (DCM) postihuje zhruba jednoho z 2500 lidí a způsobuje rozšíření a oslabení srdečního svalu, což může vést k srdečnímu selhání a náhlé smrti. Tradičně se pro její diagnostiku používalo panelové sekvenování zaměřené pouze na známé problémové geny. 

Studie srovnávala účinnost dvou přístupů: klasického panelového sekvenování a kompletnějšího genomového sekvenování u 42 pacientů s familiární formou DCM. Výsledky byly jednoznačné – genomové sekvenování poskytlo výrazně lepší pokrytí genetického materiálu a identifikovalo všechny patogenní varianty, které našlo panelové sekvenování, plus dva další významné nálezy. Jeden z nich byl přehlédnut kvůli nedostatečnému pokrytí, druhý se nacházel v genu, který vůbec nebyl zahrnut v původním panelu. 

Nejdůležitějším přínosem genomového sekvenování je jeho schopnost detekovat strukturní varianty – větší genetické změny, které tradiční panelové metody často přehlédnou. V této studii byla identifikována jedna takováto významná varianta v genu BAG3, která by jinak zůstala neodhalena. Tato schopnost činí genomové sekvenování mocným nástrojem pro odhalování dosud neznámých příčin onemocnění. 

Výzkum také ukázal, že genomové sekvenování dokáže analyzovat mnohem širší spektrum genů – místo 67 genů v panelu bylo možné zkoumat až 406 kardiologicky významných genů. To otevírá cestu k objevu nových genetických příčin kardiomyopatie. Přestože většina nově nalezených variant zatím nesplňovala klinická kritéria pro patogenitu, vytváří cennou databázi pro budoucí výzkum. 

Praktické výhody genomového sekvenování zahrnují také ekonomické aspekty. Přestože test genomu je sám o sobě dražší, eliminuje potřebu opakovaných vyšetření při negativních výsledcích a umožňuje analýzu mnoha onemocnění najednou. Klesající náklady na sekvenační technologie činí tento přístup stále dostupnějším. Pro pacienty a jejich rodiny to znamená rychlejší a přesnější diagnostiku, lepší genetické poradenství a možnost cílenější prevence u příbuzných. 

Zdroj

 Minoche, A.E., Horvat, C., Johnson, R., et al. Genome sequencing as a first-line genetic test in familial dilated cardiomyopathy. Genet Med. 2019;21(3):650-662. doi:10.1038/s41436-018-0084-7 URL: https://www.nature.com/articles/s41436-018-0084-7